Al elegir una terminal de comandos en el menú, guadaLINEX-edu nos muestra una ventana a través de la que podemos interactuar con el sistema mediante órdenes en modo texto. Los entornos gráficos, tal y como los apreciamos hoy, son un fenómeno relativamente reciente en el ambiente GNU/Linux y todavía se sigue utilizando el modo texto para muchas tareas, en especial, en labores de administración y configuración, ya que proporciona un acceso más completo y preciso a los archivos de control. De hecho, todas las aplicaciones gráficas aquí descritas pueden ser invocadas desde esta ventana de órdenes.
Lógicamente hemos de conocer la funcionalidad de los comandos y su sintaxis para poder usarlos directamente en la terminal, pero animamos al usuario curioso, a descubrir toda la potencia y belleza de este sistema, sin mediar entorno gráfico.